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    di Bernardo Lab - Systems and Synthetic Biology Lab
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    Corso di Biologia Computazionale 2008

    Programma: Biologia Computazionale: Modelli, Dinamica ed Identificazione

    Diego di Bernardo

    • Lezione 1: Cenni di biologia molecolare. Modelli dinamici non lineari per la rappresentazione della regolazione dei geni.
    • Lezione 2: Cenni sulle reti. La “Biologia dei Sistemi”: le reti di regolazione genetica e le loro proprieta' topologiche. La “Biologia Sintetica”: verso la costruzione della prima vita artificiale.
    • Lezione 3: Seminario del Dr Farren Isaacs, Harvard Unversity, USA e visita dei laboratory TIGEM (Telethon Institute of Genetics and Medicine) a Napoli.
    • Lezione 4: Identificazione di reti genetiche utilizzando sistemi dinamici lineari tempo invarianti a partire da misure allo stato stazionario. Identificazione di reti genetiche utilizzando sistemi dinamici lineari tempo invarianti a partire da serie temporali.
    • Lezione 5: Ulteriori metodi di identificazione di reti genetiche: reti Bayesiane e Mutua Informazione.

     

    Letteratura consigliata scaricabile:

    [Lucidi delle lezioni]
    [Articoli di cui si e' parlato a lezione]
    [Review dei metodi di identificazione di reti genetiche]
    [Applicazione dei metodi di identificazione di reti genetiche]
    [Review dei modelli di reti genetiche e metodi di identificazione di reti genetiche]